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Résumé

[L’apport de Produits Résiduaires Organiques (PRO) au sol est connu pour avoir un impact sur l’activité et la composition de la communauté microbienne des sols agricoles. Cependant, peu d’informations sont disponibles quant à la modulation de la réponse de cette communauté à un même apport de PRO en fonction du type de sol. Pour répondre à cette question, une expérimentation en microcosme a été réalisée. Il s’agissait de comparer l’effet de deux types de PRO (GWS : Compost de déchets verts et de boue d’épuration, ou FYM : Compost de fumier de bovin), chacun appliqué sur cinq types de sols différents. L’activité, l’abondance et la diversité des communautés microbiennes présentes dans les sols ont été analysées. Les sols ont été choisis afin d’avoir une palette contrastée de contexte pédo-climatiques. La dynamique d’évolution des émissions de CO₂ et de N₂O, de la biomasse microbienne et de la diversité taxonomique a été suivie durant les 28 jours suivant l’apport de PRO. Avant apport, les cinq sols présentaient des structures de communautés microbiennes qui leur étaient propres.  Durant les 28 jours d’incubation, les sols témoins (n’ayant reçu aucun apport de PRO) les plus riches en matière organique étaient ceux qui émettaient le plus de CO₂ et de N₂O, et qui présentait la biomasse microbienne la plus importante. L’effet de l’apport sur l’activité et la diversité microbienne des sols dépendait de la qualité du PRO apporté. Ainsi en comparaison avec GWS, l’apport de FYM induisait une augmentation de CO₂ deux fois plus importante et une émission retardée de N₂O. L’apport des deux PRO induisait des changements important au niveau de la structure des communautés prokaryotiques. L’effet des PRO sur les communautés microbiennes des sols dépendait également du type de sol. Les cinq sols de la présente expérimentation présentaient des patterns d’émissions de CO₂ et de N₂O variable après apport d’un PRO donné. Ceci est en cohérence avec le fait que chaque sol présentait une communauté microbienne qui lui était propre répondant de façon différente à un même apport. En conclusion, nos résultats montrent des types de sols différents présentant des structures de communautés microbiennes variables répondent de façon différente à un même apport de PRO (pattern d’émission de gaz à effet de serre différents). Cette réponse est également dépendante du type de PRO apporté.